Ort:  Frankfurt am Main
Datum:  13.02.2025

Bioinformatician as a postdoc (m/f/d)

Die Fraunhofer-Gesellschaft (www.fraunhofer.de) betreibt in Deutschland derzeit 76 Institute und Forschungseinrichtungen und ist eine der führenden Organisationen für anwendungsorientierte Forschung. Rund 32 000 Mitarbeitende erarbeiten das jährliche Forschungsvolumen von 3,4 Milliarden Euro.  

A new working group is currently being set up in the Clinical Microbiome Research research area at the Fraunhofer Institute for Translational Medicine and Pharmacology ITMP Frankfurt am Main. This includes a research platform that focuses on the development of microbiota-based therapies. Within this group, the bioinformatic analysis of data sets and, above all, the development of prediction

models for complex microbial communities and their interactions will play a central role. Accordingly, we are looking for a bioinformatician as a postdoc (m/w/d) to support our interdisciplinary team.

 

Was Sie bei uns tun

Microbiome evaluation and integration of additional -OMICS data and clinical data

  • Fusion and integration of -OMICS data with clinical data
  • Complementary metagenomic analysis of samples from existing biobanks
  • Carrying out statistical and bioinformatic analyses of complex data sets in a medical context

Development of new bioinformatic tools and evaluation strategies

  • Appropriation of existing bioinformatics tools and solutions, including for predicting nutrient competition of microorganisms and other mechanisms of colonization resistance
  • Development of new evaluation strategies, tools and predictive models to support the objectives of the working group
  • Validation and benchmarking of these tools and models using various data sets
  • Use of the developed solutions to identify potential Live Biotherapeutic Products (LBPs)

Support of the working group

  • Organization and management of data from microbiome studies, including quality assurance and data preparation
  • Documentation, visualization and publication of research results in specialist journals as well as presentation of the results at lectures and specialist conferences
  • Assistance in acquiring third-party funding and submitting applications for funding for clinical studies

 

Was Sie mitbringen

  • A completed scientific degree in bioinformatics, biology or a comparable field  
  • A completed PhD or submitted PhD at the time of entry, ideally with a thematic focus wihin health sciences
  • Solid knowledge of programming languages ​​such as Python, R and Bash; experience with high-performance computing (HPC) is an advantage
  • Experience in analyzing of sequence data (e.g. using tools like Qiime2, MetaPhlAn, Kraken or HUMAnN)
  • Understanding of microbiological and/or molecular biological fundamentals  
  • Interest in the human microbiome and clinical research
  • Experience in project and data management is an advantage
  • Proficent use of MS Office
  • Good command of German and English (spoken and written)
  • A high level of initiative and team spirit 

 

Was Sie erwarten können

  • Involvement in a highly innovative and patient-relevant topic
  • Integration into a competent, friendly and committed team
  • A collegial work atmosphere and the freedom to implement your own ideas
  • Flexible working hours in the flexitime model, remote work options, as well as various support measures to balance private life and career
  • Excellent professional and personal development, opportunities through a variety of internal training programs
  • Opportunity to do scientific work
  • 30 days of vacation entitlement as well as Christmas and New Year's Eve as working days 
  • Personal retirement benefits (VBL) and additional (social) benefits of public service, such as annual special payment
  • Capital-forming benefits
  • Subsidies for the Germany ticket (Deutschlandticket) 
  • Corporate benefits: Offers from well-known manufacturers and brands
  • Access to the extensive Fraunhofer network

 

Wir wertschätzen und fördern die Vielfalt der Kompetenzen unserer Mitarbeitenden und begrüßen daher alle Bewerbungen – unabhängig von Alter, Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion, Weltanschauung, Behinderung sowie sexueller Orientierung und Identität. Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung bevorzugt eingestellt.

Die wöchentliche Arbeitszeit beträgt 39 Stunden. Die Stelle ist zunächst auf 2 Jahre befristet und kann auch in Teilzeit besetzt werden. Anstellung, Vergütung und Sozialleistungen basieren auf dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD). Zusätzlich kann Fraunhofer leistungs- und erfolgsabhängige variable Vergütungsbestandteile gewähren.

 

Mit ihrer Fokussierung auf zukunftsrelevante Schlüsseltechnologien sowie auf die Verwertung der Ergebnisse in Wirtschaft und Industrie spielt die Fraunhofer-Gesellschaft eine zentrale Rolle im Innovationsprozess. Als Wegweiser und Impulsgeber für innovative Entwicklungen und wissenschaftliche Exzellenz wirkt sie mit an der Gestaltung unserer Gesellschaft und unserer Zukunft. 

Haben wir Ihr Interesse geweckt? Dann bewerben Sie sich jetzt online mit Ihren aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen. Wir freuen uns darauf, Sie kennenzulernen! 
 

Frau PD Dr. med. Lena Biehl

lena.biehl@itmp.fraunhofer.de 

Fraunhofer-Institut für Translationale Medizin und Pharmakologie ITMP 

www.itmp.fraunhofer.de 


Kennziffer: 77775                Bewerbungsfrist: 

 


Stellensegment: Clinical Research, Medical Research, Quality Assurance, QA, Healthcare, Technology, Research, Quality